• 2021年第48卷第2期文章目次
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    • >综述与专论
    • 人造细胞内蛋白质合成的研究进展

      2021, 48(2):121-134. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0163

      摘要 (1387) HTML (2791) PDF 29.88 M (2808) 评论 (0) 收藏

      摘要:无细胞蛋白质合成(cell-free protein synthesis,CFPS)是一种在体外快速合成目标蛋白质的方法,通过构建含有CFPS系统的人造细胞,能够实现蛋白质的高通量表达和功能性膜蛋白的体外重构. 本文详细综述了4种CFPS系统(包括大肠杆菌裂解液、兔网织红细胞裂解液、小麦胚芽提取物、酵母提取物)的适用范围和优缺点,总结了基于CFPS系统构建的人造细胞体系内蛋白质合成的研究现状,以及该领域面临的挑战及未来的发展方向.

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    • 外泌体环状RNA在肿瘤微环境中的研究进展

      2021, 48(2):135-146. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0191

      摘要 (1381) HTML (1165) PDF 8.95 M (4445) 评论 (0) 收藏

      摘要:外泌体是细胞分泌的30~150 nm的细胞外囊泡,在肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中介导细胞间通讯. 环状RNA(circular RNA,circRNAs)是一类由前体mRNA(precursor mRNA,pre-mRNA)反向剪接生成的非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA),在外泌体中富集且表达稳定. 本文主要讨论外泌体起源和circRNAs在外泌体中的分选调控机制,阐述外泌体circRNAs在肿瘤微环境各个阶段中的作用与机制,包括血管生成、EMT、耐药等. 最后,本文探讨外泌体circRNAs作为肿瘤标志物和治疗靶点的临床应用前景与价值.

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    • 乳酸代谢——肿瘤治疗新靶点

      2021, 48(2):147-157. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0178

      摘要 (1706) HTML (2611) PDF 5.71 M (4185) 评论 (0) 收藏

      摘要:恶性肿瘤严重危害人类健康,其治疗目前主要有手术、放疗和化疗三种方式,但疗效尚无法达到令人满意的程度,因此寻找肿瘤治疗新靶点、实现肿瘤的靶向治疗非常迫切. Warburg效应普遍存在于多种肿瘤中,其重要特征是在氧气充足的条件下,癌细胞的能量代谢仍以糖酵解为主. Warburg效应是糖酵解的典型过程,葡萄糖被大量吸收并通过糖酵解转化为乳酸. 糖酵解产物乳酸可以激活癌细胞中许多重要的信号通路,促进癌细胞的存活、侵袭、免疫逃逸、转移和血管生成. 因此,靶向乳酸代谢过程及其关键酶可能为肿瘤治疗提供新的靶点. 本文对肿瘤细胞代谢方式的改变,乳酸对肿瘤细胞免疫逃逸、肿瘤转移、肿瘤血管生成的影响,以及以乳酸为靶点的肿瘤治疗等方面进行综述.

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    • 神经递质和调质参与导水管周围灰质痛觉调控的研究进展

      2021, 48(2):158-170. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0187

      摘要 (1166) HTML (1623) PDF 1.73 M (3722) 评论 (0) 收藏

      摘要:导水管周围灰质(periaqueductal gray,PAG)在疼痛的调控过程中处于一个不可或缺的位置. 其不仅是痛觉信息上行传递的重要部位,还是疼痛抑制系统的重要组成部分. 在PAG,包括γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)、5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)和谷氨酸(glutamate,Glu)在内的神经递质以及内源性阿片肽(endogenous opioid peptides,EOP)和内源性大麻素(endocannabinoid,eCB)为代表的神经调质都参与了PAG对疼痛的信息传递以及调节. 本文重点综述GABA、5-HT、Glu、EOP和eCB在PAG参与疼痛生理调控机制的研究进展,以期为中枢神经系统的镇痛研究提供一定的理论基础.

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    • 翻译后修饰调控TRPV亚家族通道功能的研究进展

      2021, 48(2):171-183. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0181

      摘要 (1450) HTML (1126) PDF 850.52 K (4132) 评论 (0) 收藏

      摘要:瞬时受体势(transient receptor potential,TRP)通道广泛分布于神经和非神经系统中,响应温度、化学和机械等多种刺激,在机体对外界环境的精确感知中发挥重要功能. 根据蛋白质序列的相似性,哺乳动物中TRP通道家族的27个成员分属TRPA、TRPC、TRPM、TRPML、TRPP和TRPV 6个亚家族. 其中TRPV亚家族包含了6个成员,分别为温度敏感型的TRPV1~4通道,以及对Ca2+具有高选择通透能力的TRPV5和TRPV6通道. 研究结果表明,TRPV亚家族通道参与调控细胞内的离子稳态和信号传导,在温度感知和血管扩张等生理过程中发挥作用,并与癌症、心血管等多种疾病的发生和发展密切相关. 翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)是翻译中或者翻译后在蛋白质特定氨基酸上添加或删减修饰官能团的过程. 越来越多的研究结果表明,TRPV亚家族通道同样可以发生翻译后修饰,并对通道功能产生重要影响. 本文综述了目前已报道的磷酸化、糖基化、泛素化、SUMO化和共价修饰等多种翻译后修饰调控TRPV亚家族成员功能的主要研究进展,以期为进一步研究翻译后修饰对TRPV通道的功能调节提供参考,丰富我们对蛋白质翻译后修饰与生理或病理活动相关性的认识.

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    • PDZ连接激酶,又一新的原癌基因

      2021, 48(2):184-191. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0213

      摘要 (1410) HTML (1442) PDF 2.06 M (2819) 评论 (0) 收藏

      摘要:PDZ连接激酶(PBK)是一种丝-苏氨酸激酶,属于丝裂原活化蛋白激酶激酶(MAPKK)家族成员. PBK能调控细胞周期进程,促进细胞增殖. 近年发现,其在乳腺癌、结肠癌、皮肤癌和前列腺癌等多种恶性肿瘤组织中均呈高表达,与多种癌症预后不良关联密切. PBK主要通过Wnt、PI3K/AKT/mTOR和MAPK等信号通路,调控肿瘤细胞有丝分裂,参与多种癌症的增殖、侵袭转移和耐药等,并受miR-216b-3p、miR-770-5p和miR-372-5p等多种microRNA调控. 提示PBK可能作为又一新的原癌基因,有望成为抑癌药物新的分子靶点.

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    • >研究报告
    • Ash2l-1调控小鼠卵黄囊早期造血

      2021, 48(2):192-203. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0237

      摘要 (1512) HTML (786) PDF 36.43 M (2176) 评论 (0) 收藏

      摘要:作为甲基转移酶MLL/SET1复合体的核心成分之一,ASH2L能够促进组蛋白H3K4me3修饰的形成,并在小鼠早期胚胎发育过程中行使重要功能. 在小鼠中,由于启动子的选择性使用,Ash2l会转录成两种不同长度的转录本并形成两种蛋白质亚型:ASH2L-1和ASH2L-2. 目前有关该基因在小鼠胚胎发育中的作用机制及不同亚型的功能还不清楚. 本文利用CRISPR/Cas9技术特异敲除Ash2l-1并研究该亚型的生理学功能. 研究结果发现,当Ash2l-1缺失时,小鼠胚胎在E9.5~E10.5时发生致死. 特别是Ash2l-1-/- E9.5胚胎的卵黄囊血管和早期造血发育存在明显缺陷. 转录组测序结果显示,Ash2l-1的缺失影响红细胞发育和成熟、血管发生和形成相关基因的表达. H3K4me3的CUT&RUN结果显示,在一些表达下调关键基因的启动子区,H3K4me3修饰水平出现下降. 以上结果表明,Ash2l-1在小鼠卵黄囊的早期造血和血管形成过程中是必不可少的,它可能是通过调控关键基因启动子区的H3K4me3修饰水平而控制这些基因的表达,从而在相关过程中行使功能.

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    • 一种溶酶体靶向的原位自组装短肽设计及抗肿瘤活性研究

      2021, 48(2):204-213. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0170

      摘要 (1243) HTML (881) PDF 29.66 M (1863) 评论 (0) 收藏

      摘要:肿瘤已成为威胁人类生命的一大杀手,目前主要采用手术和放、化疗等手段进行治疗,但由于放、化疗的细胞选择性差、毒副作用明显且易引起肿瘤细胞产生耐受(/药)性,不利于肿瘤的持续治疗,因此亟待研发具有定向定位优势、毒副作用低的新型靶向药物. 原位自组装多肽能识别肿瘤部位的特异性高表达物质,在肿瘤部位靶向性聚集形成稳定的纳米结构,实现精准和高效治疗,有望成为一种新型的抗肿瘤药物. 本研究基于多肽原位自组装的设计理念,利用溶酶体内组织蛋白酶L的催化活性,设计了靶向溶酶体且能够原位自组装的多肽分子Fmoc-FFRIKFERQ-OH,研究了该分子的自组装特性及抗肿瘤活性. 结果显示,在体外酸性条件下,组织蛋白酶L能精准切割Fmoc-FFRIKFERQ-OH分子,其酶切产物Fmoc-FFR-OH自组装形成长纳米纤维结构,对肿瘤细胞A375和SH-SY5Y均具有较好的杀伤作用. 该分子通过靶向溶酶体杀伤肿瘤细胞且对正常细胞的毒性较低,有望成为一种新型的抗肿瘤药物.

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    • >技术与方法
    • Orbitrap Exploris 480质谱在定量蛋白质组学应用中的优化和评测

      2021, 48(2):214-226. DOI: 10.16476/j.pibb.2020.0245

      摘要 (1966) HTML (2081) PDF 7.90 M (4567) 评论 (0) 收藏

      摘要:基于数据依赖的扫描模式(data-dependent acquisition,DDA)和数据非依赖的扫描模式(data-independent acquisition,DIA)的非标记定量(label-free quantitative,LFQ)和同位素标记TMT(tandem mass tag)定量是蛋白质组学定量中较常见的技术. 本文利用最新的Orbitrap Exploris 480质谱,优化了DDA、FAIMS DDA、FAIMS DIA的非标记定量方法以及TMT定量策略的关键质谱参数,并将其应用在人细胞蛋白质组、单细胞蛋白质组、血浆蛋白质组和酵母蛋白质组分析. 结果表明,在DDA实验中,设置碰撞能量为27、二级谱图的分辨率为15 K、最大离子注入时间为22 ms是最佳的参数组合. 针对极微量样品200 pg~5 ng,可以根据样品量相应设置最佳的质谱参数. 使用200 pg和500 pg的HeLa细胞样品,分别鉴定到1 259和1 725个蛋白质,从而实现了单细胞蛋白质组学的深度覆盖. 在FAIMS DDA实验中,60 min或90 min梯度时选择CV-45V的补偿电压,120 min或150 min梯度时选择CV-45V-65V补偿电压组合,可以获得最佳的蛋白质鉴定结果. 从293T蛋白质组中分别在60、120和150 min中鉴定6 300、6 994和7 500个蛋白质. 在FAIMS DIA实验中,使用CV-45V-65V双补偿电压切换,60个隔离窗口来获得最佳的蛋白质鉴定数目和定量重现性. 在60 min内分别在293T细胞和去除高峰度的血浆中定量到7 019个细胞蛋白和1 077个血浆蛋白. 在TMT定量实验中设置APD开启、“Precursor Fit”阈值70和Turbo TMT功能的组合同时增加了TMT定量蛋白质的数量和TMT定量的准确性. 在TMT11-plex标记的酵母蛋白质组中60 min即可定量10 989个多肽和2 162个蛋白质. 综上所述,本研究中优化的多种非标记定量和TMT定量方法为Orbitrap Exploris 480在蛋白质组学更广泛的应用提供了参考.

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