微生物的某些多肽抗生素，以及肽聚糖的交联肽等在合成途径和氨基酸组成、结合方式上都与动物活性多肽不同。它们不象动物多肽那样首先由核糖体合成出其前体，然后经酶促裂解形成，而是直接由各自的多酶体系控制合成。其合成不被嘌呤霉素、链霉素等抑制，也不为核酸酶的处理所终止。负责肽抗生素合成的酶系的各组分，彼此间有严格的空间结构和功能的联系。与核糖体合成蛋白质相比，酶控制的肽合成的精确性较差。