麦胚凝集素(WGA)分子由两个相同原体组成。WGAⅡ的原体为一条171个氨基酸残基的多肽链，肽链可分成四段，各段氨基酸顺序呈明显同系现象，折叠成形态相似的结构域。WGA的高级结构有明显对称性。二原体交界处有两对糖结合部位，能借氢键和疏水相互作用特异地结合N-乙酰葡糖胺和N-乙酰神经氨酸及其衍生物和寡聚糖。WGA与某些细胞上依赖糖的受体作用引起生物效应，其特殊的空间结构是重要的。