基于格子模型的蛋白质设计方法
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国家自然科学基金(10174005,30170230)和北京市自然科学基金(5032002)资助项目.


A Protein Design Procedure Based on The Lattice Model
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This work was supported by grants from The National Natural Sciences Foundation of China (10174005,30170230) and Beijing Natural Science Foundation (5032002).

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    摘要:

    提出一个简单有效的蛋白质设计方法,这一方法完全基于物理学原理. 与同类工作相比,该方法在很大程度上可节省对序列空间进行的搜索,是对同类工作的简化与发展. 对三个平面格子模型进行的检验表明该方法是成功的. 该方法可进一步用于真实蛋白质的三维非格子模型.

    Abstract:

    A new simple and effective approach completely based on the physical theory is proposed for protein design. Compared with the similar works, the algorithm saves a vast deal of trouble in exploring sequence space. The method is an improvement over previous works. The design procedure was tested on three lattice models in two dimensions and the successful results have been obtained. The method can be readily implemented for three-dimensional off-lattice models of real proteins.

    参考文献
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    引证文献
引用本文

刘赟,王存新,王宝翰,陈慰祖.基于格子模型的蛋白质设计方法[J].生物化学与生物物理进展,2004,31(2):172-176

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  • 收稿日期:2003-08-18
  • 最后修改日期:2003-09-28
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