基于Web的基因组浏览器研究现状
DOI:
作者:
作者单位:

哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院,哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院,哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院

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中图分类号:

基金项目:

国家高技术研究发展计划(863)(2012AA02A604),国家自然科学基金(61471147, 61173085)和黑龙江省博士后基金(LBH-Q13084)资助项目


Progress on Web?鄄based Genome Browser Technology
Author:
Affiliation:

School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology,School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology,School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology

Fund Project:

This work was supported by grants from Hi-Tech Research and Development Program of China (2012AA02A604), The National Natural Science Foundation of China(61471147, 61173085) and Postdoctoral Science Research Developmental Foundation of Heilongjiang Province (LBH-Q13084)

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    摘要:

    测序技术的发展促使人类基因组测序成本急剧降低,测序速度迅速增加,对这些数据的分析和可视化已成为生命科学领域最重要的课题之一.基因组浏览器技术在基因序列分析,遗传密码解读,复杂疾病研究等方面具有重要意义.本文综述了9种主要的基因组浏览器技术,并从可视化内容、可视化形式、软件系统架构等角度分析了它们的特点.最后,探讨了基因组浏览器发展所面临的挑战.

    Abstract:

    Advances in sequencing technology have led to a sharp decrease in the cost and rapid increase in the speed of sequencing an entire human genome. It has become one of the most important issues to analyze and visualize genome sequence in life science field. Genome browser technology plays important roles in analyzing genome sequence, interpreting genetic codes, studying complex diseases and so on. In this paper, we review the nine major genome browser technologies and analyze their characteristics in visualized content, visible form, software system architecture and so on. Finally, we discuss the challenges that genome browser faced.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

张海川,李杰,王亚东.基于Web的基因组浏览器研究现状[J].生物化学与生物物理进展,2014,41(11):1182-1190

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  • 收稿日期:2014-03-01
  • 最后修改日期:2014-05-29
  • 接受日期:2014-06-04
  • 在线发布日期: 2014-11-21
  • 出版日期: 2014-11-20