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基于质谱的磷酸化蛋白质组学: 富集、检测、鉴定和定量
Phosphoproteomics Based on Mass Spectrometry(MS): Enrichment, Detection, Assignment and Quantification
投稿时间:2018-11-11  修订日期:2018-12-07
中文关键词:  磷酸化蛋白质组学,方法,串联质谱,修饰位点解析
英文关键词:phosphoproteomics, methodology, LC-MS/MS, confident phosphosite assignment
基金项目:国家重点研发计划(2017YFA0505102)、国家自然科学基金(31770886, 31770892, 31700682)资助项目
作者单位E-mail
石文昊 国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京 102206清华大学生命科学学院北京 100084 whaosmith@163.com 
童梦莎 国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京 102206清华大学生命科学学院北京 100084  
李恺 国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京 102206  
王钰珅 国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京 102206清华大学生命科学学院北京 100084  
丁琛 国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京 102206复旦大学生命科学学院上海 200438 chend@fudan.edu.cn 
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中文摘要:
      磷酸化是一种调控生命活动的重要翻译后修饰,调控生物的生长发育、信号转导、以及疾病的发生发展.从上世纪80年代开始,质谱应用于蛋白质磷酸化的检测中,极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展.质谱检测拥有高灵敏度、高通量的特点,更重要的是具有位点分辨率,因此基于质谱的磷酸化蛋白质组检测方法得到不断的发展和推广.常见的磷酸化蛋白质组研究,首先对磷酸化肽段进行富集,然后进行串联质谱分析,最后通过搜索引擎对修饰位点进行鉴定和定量.本文从这个三个基本方面,对磷酸化蛋白质组研究进行综述,并对未来研究发展方向进行讨论.
英文摘要:
      Protein phosphorylation is one of post-translational modifications (PTM), which plays a role in regulation of development, signal transduction, and processes of diseases. Because of high sensitivity, considerable throughput, and residue resolution, mass spectrometry (MS) has been the most popular tool for phosphorylation modification analysis. Common MS-centric phosphoproteomics workflow includes phosphorylation modified peptides sampling, LC-MS/MS detection, phosphorylation sites assignment and quantification. We summarized and discussed these workflow parts in this review.
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