• 2007年第34卷第6期文章目次
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    • >微型述评
    • 24p3-24p3受体系统:一种新的铁转运途径

      2007, 34(6):557-561.

      摘要 (4276) HTML (23) PDF 0.00 Byte (5704) 评论 (0) 收藏

      摘要:小鼠24p3是脂质运载蛋白lipocalin家族的成员之一,可在白介素3 (interleukin-3,IL-3) 缺乏时诱导细胞发生凋亡,并参与细胞的铁转运过程. 最近,Devireddy等又成功克隆到了24p3的细胞表面受体 (24p3 receptor,24p3R),进一步确定了24p3-24p3R这一新的铁转运途径. 该途径的发现不仅增加了对铁转运理论新的认识,更重要的是,这一发现为铁代谢调控细胞凋亡理论的建立奠定了基础.

    • >综述与专论
    • 氨基酰-tRNA合成酶与神经退行性疾病

      2007, 34(6):562-566.

      摘要 (5047) HTML (363) PDF 0.00 Byte (1303) 评论 (0) 收藏

      摘要:氨基酰-tRNA合成酶催化tRNA的氨基酰化反应为生物体内的蛋白质合成提供原料.这类古老且保守的蛋白质分子在高等生物复杂的细胞分子网络中分化出的新功能是目前人们关注的焦点. 近期在对一些患有神经退行性疾病的病人和小鼠模型的研究中发现,位于酪氨酰-tRNA合成酶、甘氨酰-tRNA合成酶和丙氨酰-tRNA合成酶上的突变,可分别导致DI腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease,CMT) C型,腓骨肌萎缩症2D型及小脑浦肯雅(Purkinje)细胞丢失. 初步的致病机理研究表明,致病突变对这3种酶的影响各不相同:酪氨酰-tRNA合成酶的氨基酰化催化能力受到影响,甘氨酰-tRNA合成酶受影响的可能是一种未知的新功能,而丙氨酰-tRNA合成酶受影响的则是它的编校功能.这些研究结果揭示了氨基酰-tRNA合成酶涉及神经退行性疾病的广泛性和其机制的复杂性,并将促进对神经退行性疾病这一类常见疾病的病理和治疗方法的研究.

    • 适体酶Aptazymes的研究进展

      2007, 34(6):567-572.

      摘要 (4286) HTML (52) PDF 0.00 Byte (6220) 评论 (0) 收藏

      摘要:适体酶是从寡核苷酸随机序列库中筛选获得的针对各种效应分子的一种新的人工合成酶. 它具有适体的特异性和核酶的催化活性. 适体酶作为催化分子信标,为效应分子的定量分析提供了新的思路. 适体酶不仅在基因组学和蛋白质组学中应用,而且在生物传感器和DNA分子逻辑研究中具有潜在的应用前景.

    • 蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究

      2007, 34(6):573-579.

      摘要 (4659) HTML (40) PDF 0.00 Byte (13580) 评论 (0) 收藏

      摘要:细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响. 蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据库的构建和亚细胞定位分析及预测加速了蛋白质结构和功能的研究.

    • >研究快报
    • MIF调节巨噬细胞系RAW264.7中TNF-alpha Ⅱ型受体的表达

      2007, 34(6):580-584.

      摘要 (4052) HTML (39) PDF 0.00 Byte (4410) 评论 (0) 收藏

      摘要:巨噬细胞迁移抑制因子 (MIF) 在调节固有免疫和获得性免疫中发挥重要作用,在炎症、败血症和自身免疫疾病中都有它的参与. MIF可以刺激巨噬细胞表达TNF-α、IL-1β、IL-6和IL-8等多种细胞因子. 在最近的研究中发现,外源性的MIF可以上调RAW264.7细胞中TNF-α Ⅱ型受体的mRNA水平, 细胞自分泌的MIF对维持TNF-α Ⅱ型受体的基线水平有很大作用. 这种调节作用可以被Src和JNK抑制剂所阻断. 在巨噬细胞活化过程中,MIF这一新发现的功能提示它在放大炎症信号的同时,还能消减TNF-α可能引起的凋亡和细胞毒等副作用.

    • >研究报告
    • 磷酸化对多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构的影响研究

      2007, 34(6):585-594.

      摘要 (5126) HTML (401) PDF 0.00 Byte (15611) 评论 (0) 收藏

      摘要:多肽和蛋白质中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构对其构象与功能有重要影响. 设计合成了一系列模型多肽及其磷酸化多肽,并采用核磁共振实验和分子动力学模拟的方法,研究了所合成多肽中肽脯酰胺键的顺反异构化. 结果表明,对脯氨酸之前的Xaa残基进行侧链O-磷酸化会极大地影响该顺反异构化过程,进而调节肽链构象. 此外,磷酸化使得多肽顺式构象比例增加,且当磷酸基团不带负电荷时顺式构象所占比例最大. 同时,分子动力学模拟所得结果与核磁共振实验相一致,包括最稳定构象和顺反构象统计分布. 磷酸基团所带电荷及其空间位阻可能是影响这类磷酸化多肽构象变化的主要因素.

    • 斑马鱼胚胎中受Nodal信号调控基因的鉴定

      2007, 34(6):595-603.

      摘要 (4679) HTML (0) PDF 0.00 Byte (4907) 评论 (0) 收藏

      摘要:Nodal信号在脊椎动物胚胎发育的中内胚层诱导、左右不对称性的建立、神经外胚层沿前后轴线的分化等方面起着重要的作用. 为鉴定受Nodal信号调控的基因,特别是那些转录因子基因,通过将来自squint过量表达、缺失Nodal信号的MZoep突变体或野生型30%外包期胚胎的RNA与Affymetrix斑马鱼寡核苷酸芯片杂交. 发现与野生型样本相比,在squint 过量表达的样本中,265个转录本的表达显著增强 (log2 ratio>1),111个转录本的表达显著减弱 (log2 ratio<-1);在MZoep样本中,表达显著增强的 (log2 ratio>1)转录本有1 495个,表达显著减弱 (log2 ratio<-1) 的有550个. squint 过量表达使26个转录因子基因的表达增强,11个转录因子基因的表达减弱;另一方面,MZoep突变体中表达增强的转录因子基因为69个,表达减弱的转录因子基因为30个. 这些结果为进一步研究Nodal信号的转导机理和生物学功能提供了有益的数据.

    • 肿瘤坏死因子α通过激活NF-κB信号通路加快肝细胞周期进程

      2007, 34(6):604-610.

      摘要 (4754) HTML (104) PDF 0.00 Byte (5246) 评论 (0) 收藏

      摘要:在慢性炎症部位有易发肿瘤的倾向,大约有20%的恶性肿瘤发生与慢性炎症相关,肝细胞癌是世界第三大癌症死亡病因,其患者多数有慢性炎症病史,当炎症慢性迁延,肝细胞癌发生率明显增加. 但慢性炎症与肿瘤发生与发展的细胞和分子机制仍然不清楚. 利用人肝细胞株L-02细胞,研究肿瘤坏死因子α (TNF-α)对细胞周期的影响及其机制,并探讨核因子κB(NF-κB)和ERK1/2活化对细胞周期的影响,以期能更确切地阐明炎症介质TNF-α在肝细胞癌发生发展中的作用. 发现TNF-α能促进肝细胞从G0/G1期向S期转换. 蛋白质印迹检测表明,TNF-α能以剂量依赖方式诱导cyclin D1表达,而对cyclin E的表达无明显影响. 同时TNF-α能激活NF-κB,ERK1/2,抑制NF-κB活化降低了TNF-α诱导的cyclin D1表达,导致细胞周期阻滞于G0/G1期. 抑制ERK1/2活化则对细胞周期和cyclin D1表达无显著影响. 结果提示,TNF-α通过活化NF-κB信号通路,诱导cyclin D1表达,加快细胞周期进程,这可能是促进肿瘤的发生发展重要机制. 针对TNF-α和NF-κB的治疗可能延长慢性炎症相关性肿瘤的潜伏期和抑制肿瘤的发展.

    • 载脂蛋白A-Ⅰ通过PKA信号途径影响ABCA1的表达与功能

      2007, 34(6):611-619.

      摘要 (4694) HTML (131) PDF 0.00 Byte (7678) 评论 (0) 收藏

      摘要:以THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞为研究对象,观察载脂蛋白A-Ⅰ与三磷酸腺苷结合盒转运体A1(ATP binding cassette transporter A1,ABCA1)的相互作用,并探讨它们相互作用的机制,以便了解载脂蛋白A-Ⅰ和ABCA1在动脉粥样硬化发生发展中的作用. THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞经各种因素处理后,采用油红“O”染色, 观察细胞内的脂滴,运用液体闪烁计数器检测细胞内胆固醇流出,高效液相色谱分析细胞内总胆固醇、游离胆固醇和胆固醇酯含量, 用逆转录-聚合酶链反应和蛋白质印迹分析法分别检测ABCA1 mRNA与ABCA1蛋白质的水平. 实验结果显示,载脂蛋白A-Ⅰ和腺苷酸环化酶激动剂Forskolin(FRK)引起THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞总胆固醇、游离胆固醇与胆固醇酯减少,而腺苷酸环化酶抑制剂SQ-22536引起THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞总胆固醇、游离胆固醇与胆固醇酯增加. 载脂蛋白A-Ⅰ引起THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞ABCA1蛋白质水平和细胞内胆固醇流出增加. FRK引起THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞ABCA1蛋白质水平和细胞内胆固醇流出呈时间和浓度依赖性增加. SQ-22536引起THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞ABCA1蛋白质水平和细胞内胆固醇流出减少. 结果提示,载脂蛋白A-Ⅰ可提高THP-1巨噬细胞源性泡沫细胞ABCA1蛋白质水平,增加细胞内胆固醇流出, 降低细胞内胆固醇聚积. 其机制可能是通过PKA信号途经使细胞ABCA1蛋白质水平增加.

    • 线虫中的小分子热休克蛋白HSP12.1具有类分子伴侣活性

      2007, 34(6):620-624.

      摘要 (4026) HTML (6) PDF 0.00 Byte (5974) 评论 (0) 收藏

      摘要:很多种类的小分子热休克蛋白 (small heat shock protein,sHSP) 都能在胁迫条件下抑制蛋白质的聚集,显示出了类分子伴侣活性,这种活性是ATP非依赖型的. 从已经进行的实验发现,线虫C.elegans中最小的小分子热休克蛋白家族成员HSP12.1具有类分子伴侣活性,以胰岛素、乙醇脱氢酶和溶菌酶做底物发现HSP12.1能够一定程度地抑制底物的热聚集,虽然这种活性较一些经典的分子伴侣蛋白(线虫中的HSP16.1)要低. 与此不同,另外3种和其分子质量相近的sHSP12s (HSP12.2、HSP12.3和HSP12.6)却没有检测出这样的类分子伴侣活性,虽然它们在一级结构上有很高的相似性. 另外,在大肠杆菌中表达HSP12.1蛋白能够提高细菌在高温环境下的生存率,45℃处理后的生存率比未表达HSP12.1的菌高4倍左右,不过在线虫中是否发挥同样的功能还不是很清楚. 从研究结果来看,C端“尾巴”结构域对sHSP发挥类分子伴侣活性不是必要的,在HSP12.1中没有C端“尾巴”结构域也有类分子伴侣活性就证明了这一点. N端结构域可能在发挥类分子伴侣活性中发挥比较重要的作用,当然α-crystallin结构域也可能参与到发挥这样的功能当中.

    • 芯片数据标准化方法比较研究

      2007, 34(6):625-633.

      摘要 (4132) HTML (24) PDF 0.00 Byte (4881) 评论 (0) 收藏

      摘要:在基因芯片实验中,基因表达水平之间的相关性在推断基因间相互关系时起到非常重要的作用. 未经标准化处理的芯片数据基因之间往往都呈现出很强的相关性,这些高相关性一部分是由基因表达水平变化引起的,而另外一部分是由系统偏差引起的. 对芯片数据进行标准化处理的目的之一是消除系统偏差引起的高相关性,同时保留由真正生物学原因引起的基因表达水平高相关性. 虽然目前对标准化方法已经有了不少比较研究,但还较少有人研究标准化方法对基因之间相关系数的影响,以及哪种方法最有利于恢复基因之间的相关性结构. 通过对基因表达水平数据的模拟,具体比较了几种常用标准化方法的效果,从而给出最有利于恢复基因之间相关性结构的那种标准化方法.

    • 含蛋白质转导域的Ngb融合蛋白的原核表达、纯化及其生物学活性的初步研究

      2007, 34(6):634-641.

      摘要 (4045) HTML (6) PDF 0.00 Byte (4887) 评论 (0) 收藏

      摘要:以SD大鼠脑组织RNA为模板,利用RT-PCR技术,将HIV-1 反式激活蛋白(TAT)中具有蛋白质转导功能的9个氨基酸序列,即蛋白质转导域(PTD)基因与脑红蛋白(Ngb)基因融合,应用T-A克隆技术将融合基因与pMD19-T simple载体连接,经测序正确后克隆至表达载体pET28b中,转化感受态E.coli BL21 (DE3) plysS,得到的转化子经IPTG诱导后获得可溶性表达,并经蛋白质印迹检测进一步鉴定.表达产物经Ni2+亲和纯化层析、脱盐后在原代培养的大鼠皮质神经元进行生物学活性检测,结果显示,TAT PTD-Ngb融合蛋白可以转运入皮质神经元内,在48 h内可检测到其存在,并能提高缺氧条件下皮质神经元存活率、减少缺氧诱导的皮质神经元的凋亡. 这一结果为进一步研究TAT PTD-Ngb的神经保护机制提供了线索,并可能为神经系统疾病尤其是脑血管疾病、神经系统退行性疾病提供了一个新的治疗策略.

    • β-catenin 在胎牛蹄边缘毛囊形态发生中表达的时空变化

      2007, 34(6):642-646.

      摘要 (3408) HTML (52) PDF 0.00 Byte (4327) 评论 (0) 收藏

      摘要:以胎牛为实验动物,应用免疫组化方法定性检测β-catenin在胎牛蹄边缘表皮和毛囊形态发生中表达的时空变化,探讨胎牛蹄边缘毛囊形态发生中β-catenin表达的时空变化规律. 结果显示:β-catenin在胎牛蹄边缘毛囊形态发生早期 (68~93天)表达于表皮、基底层、基板和毛芽中,其中基底层、基板、毛芽中呈强阳性,表皮中呈中阳性;在毛囊形态发生中期 (94~184天)表达于基底层、表皮和毛钉中,其中基底层、表皮、隆突区、内外根鞘和漏斗部呈中阳性;在毛囊形态发生晚期 (184~225天)只在表皮及基底层有表达,其中基底层呈弱阳性,表皮呈强阳性. β-catenin表达的时空变化规律提示,在胎牛蹄边缘毛囊的形态发生过程中β-catenin具有重要作用.

    • 嗜水气单胞菌AH-1 quorum sensing 负调控Ⅲ型分泌系统的表达

      2007, 34(6):647-652.

      摘要 (3692) HTML (0) PDF 0.00 Byte (4813) 评论 (0) 收藏

      摘要:通过构建嗜水气单胞菌AH-1 Quorum Sensing (QS) 2个关键调节基因ahyI,ahyR的突变菌株,来系统分析嗜水气单胞菌AH-1Ⅲ型分泌系统基因,揭示它们由QS系统调控. 在ahyI突变菌中,TTSS分泌效应因子(effector) aexT 量显著提高.通过构建LacZ-TTSS基因启动子融合表达,进一步表明QS系统负调控编码TTSS 组分的基因.

    • 爪蟾p21活化激酶2参与卵母细胞胞质分裂过程不依赖于Cdc42

      2007, 34(6):653-658.

      摘要 (3616) HTML (34) PDF 0.00 Byte (6979) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究p21活化激酶2 (p21-activated kinase 2,PAK2) 在卵母细胞成熟过程中的作用. 以爪蟾卵母细胞为模型,分别向爪蟾卵母细胞显微注射PAK2-N端(PAK2-N-terminal,PAK2-NT)和PAK2-N端突变体(PAK2-N-terminal mutation,PAK2-NTm) mRNA,荧光显微镜下观察胚泡破裂发生. 采用共聚焦显微镜,时间延迟摄影法观察正常卵母细胞、PAK2-NT mRNA注射组和PAK2-NTm mRNA注射组卵母细胞胞质分裂、极体形成及与Cdc42活性的关系. 结果表明,PAK2-NT mRNA和PAK2-NTm mRNA注射组的卵母细胞与正常卵母细胞胚泡破裂发生相似,但PAK2-NT mRNA和PAK2-NTm mRNA注射组未见胞质分裂和极体形成. 结果提示,PAK2参与卵母细胞胞质分裂和极体形成可能不依赖于Cdc42的调节过程.

    • >技术与方法
    • 基于旋转偏振角的线偏振扫描成像方法研究

      2007, 34(6):659-663.

      摘要 (5616) HTML (132) PDF 0.00 Byte (5552) 评论 (0) 收藏

      摘要:提出一种基于旋转偏振角的新的偏振光成像方法:改变入射线偏振光偏振角和检偏角,采集样品图像系列,总结出背向散射光2个正交偏振分量的光强差关于入射线偏振光偏振角和检偏角的函数关系式. 通过对模拟散射介质,猪肉脂肪,猪肉骨骼肌和牛肉骨骼肌等样品进行实验,论证了偏振差函数式中各个参数与样品光学特性之间的联系,并从中提取出2个相互独立的参数,分别表征样品的纤维方向角和光学各向异性度,从而实现对样品浅表层光学特性进行定量测量. 和普通光强图像相比,用这些独立的光学信息生成不同基色的图像,能更直观明了地区分组织结构差异,具有潜在的临床医学应用价值,如成为一种皮肤疾病、皮肤损伤的检测方法.

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