摘要:20 世纪 90 年代初，以完成人类基因组全序列测定和注释为核心任务的人类基因组计划在美国的领导下兴起．自1999年中国加入人类基因组计划到现在的10年时间里，中国基因组学得到了快速的发展，建立了先进的基因组学技术平台，并出色完成了多项重大基因组科学研究项目，对我国生命科学各个领域的发展产生了重要影响．结合我国基因组学研究现状，《中国科学C辑·生命科学》(Sci China Ser C-Life Sci) 2009年第1期发表了中国基因组学专题，综述了基因组测序、分型，功能基因检测技术和生物信息学分析技术，以及肝癌、免疫和环境与工业微生物的基因组学研究等方面的研究工作．

摘要:Kindlin是一族新发现的黏着斑蛋白，包括Kindlin-1、Kindlin-2和Kindlin-3三个成员．不同Kindlin家族成员在进化上具有高度同源性和保守性，参与了多种重要细胞生理过程，例如细胞迁移、增殖和分化的调控．Kindlin通过与β整合素胞内段的相互作用，在细胞-细胞外基质黏附、细胞-细胞间连接、细胞骨架重构以及整合素介导的双向信号传递中都具有重要作用．Kindlin家族成员的异常与多种遗传性疾病、心血管疾病及肿瘤的发生和发展密切相关．Kindlin与整合素作用机制的深入研究，不但可以丰富对细胞黏附和迁移的理论认识，而且将有助于临床上相关疾病的治疗．

摘要:Sirtuin蛋白是一组具有NAD⁺依赖性的组蛋白去乙酰基转移酶，该家族成员具有高度保守的催化结构域，可以通过对多种底物进行去乙酰化作用，从而在机体内参与一系列的生物学活动，包括维持细胞抗胁迫能力和基因组稳定性以及参与能量代谢等．Sir2参与了酵母的交配型基因、端粒和rDNA 重复序列的沉默以及细胞寿命等生理功能．在哺乳动物中，SIRT1是该家族中目前研究最为广泛且较为透彻的成员，而SIRT6的功能研究成为近年来继SIRT1后的又一新热点．综述了sirtuin蛋白的结构及其与衰老关系的研究进展．

摘要:近年来，基于质谱技术的高通量蛋白质组学研究发展迅速，利用串联质谱图谱鉴定蛋白质是其数据处理中一个基础而又重要的环节．由于不需要利用蛋白质序列数据库，从头测序方法能够分析新物种或者基因组未测序物种的串联质谱数据，具有数据库搜索方法不可替代的优势．简要介绍高通量串联质谱图谱从头测序问题及其研究现状．归纳出几种典型的计算策略并分析了各种策略的优缺点．总结常用的从头测序算法和软件，介绍算法评估的各种指标和常用评估数据集，概括各种算法的特点，展望未来研究可能的发展方向．

摘要:应用反向遗传学技术，选择冷适应、温度敏感、减毒的A/Ann Arbor/6/60 ca (H2N2)型流感病毒的6个内部基因为骨架，与A/California/07/2009株流感病毒2个抗原基因HA、NA分别克隆到polⅠ-polⅡ转录表达载体pAD3000中，构建8个转录表达载体重组质粒，共转染Vero细胞，获得重配A/California/07/2009ca株流感病毒．重配病毒的TCID₅₀为7.5，病毒传4代后其血凝素(HA)滴度稳定在1∶256，半数感染剂量EID₅₀为8，鸡胚传20代，经RT-PCR鉴定未发现重组病毒基因突变，电镜观察重配病毒符合流感病毒的主要特征；蔗糖纯化的病毒经肌肉注射(灭活)及滴鼻(减毒活病毒)两种途径免疫BALB/c小鼠，结果显示：滴鼻免疫和肌肉注射都可以产生较高效价的血凝抑制(HI)抗体，肌肉注射组产生的HI抗体略高(P = 0.044)，但肌肉注射组检测不到高效价IgA抗体；滴鼻免疫组鼻冲洗液中可以检测到高效价的IgA抗体，同型病毒感染后，IL-1β、TNFα、IFN-α等前炎因子分泌较早，且高于肌肉注射组(P < 0.05)，可见，喷鼻减毒疫苗比灭活全病毒疫苗能更好地激发黏膜免疫反应．通过对小鼠各个器官病毒载量的检测发现，4天后鼻腔、气管、脑、肺、脾脏没有病毒存在，证明减毒活疫苗株在小鼠上是安全的．以上数据可以初步断定，重组病毒有作疫苗候选株的可能，而且喷鼻疫苗具有降低免疫剂量、同时激活体内体液免疫和细胞免疫的功能．

摘要:主要研究采用微接触印刷术在生物材料表面制备的细胞外基质蛋白微图形对人体软骨细胞粘附、铺展以及蛋白质表达等细胞行为的影响．研究结果表明，蛋白质微图形表面对细胞的粘附、铺展、排列以及细胞蛋白质表达具有明显的影响．细胞优先粘附在微图形蛋白区域，微图形形状以及尺度明显影响细胞的粘附形态以及铺展程度，同时也影响细胞生长过程中的Ⅱ型与Ⅵ型胶原蛋白的表达，细胞的铺展行为与细胞的蛋白质表达具有一定的正相关性，铺展较好的细胞表现出更好的Ⅱ型与Ⅵ型胶原蛋白表达．结果表明，通过在材料表面制备细胞外基质蛋白微图形可以有效调控人体软骨细胞的生长行为与功能．

摘要:哺乳动物肺组织发育的基本模式总体分为上皮分支的形态发生和分隔膜的形成两个部分．基因p311是克隆到的一个在分隔膜形成阶段特异表达的基因，可能在肺泡发育中起重要作用．为进一步探讨神经元蛋白3.1(P311)对肺发育过程的影响，构建了小鼠肺组织 cDNA文库，以融合Gal4 DNA结合结构域的重组P311蛋白为诱饵，利用酵母双杂交技术从文库中筛选P311结合蛋白．通过免疫共沉淀和双分子荧光互补等技术进一步验证， SPARC(secreted protein, acidic and rich in cysteine)被确定为P311 相互作用蛋白．进一步的研究发现，SPARC在肺组织中具有与P311相似的表达时序特征，双重免疫组织化学染色显示SPARC和P311在小鼠肺组织中共定位于肺泡上皮细胞和肌成纤维细胞中．提示P311可能通过与SPARC的相互作用影响肺泡发育．

摘要:土槿皮乙酸(pseudolaric acid B，PAB)是土槿皮(金钱松根皮)的主要生物活性成分，对多种人肿瘤细胞有细胞毒性作用．高内涵分析(high content analysis，HCA)是一种基于荧光显微技术的新技术，它以细胞为研究对象，可以同时对多个 荧光靶点的荧光强度、分布，以及细胞形态进行自动化定量分析．利用高内涵分析、流式细胞术研究PAB 对人乳腺癌MCF-7 细胞抑制作用的机制．磺酰罗丹明实验显示，PAB 抑制MCF-7 细胞增殖，且呈现出剂量和时间依赖性，72 h IC₅₀为(1.80±0.33) μmol/L．流式细胞术碘化丙锭(PI)单染显示PAB 作用24 h，可致MCF-7 细胞 G2/M 期比例增至93% 以上，annexin V-FITC 和PI 双染显示PAB 促进MCF-7 细胞凋亡．高内涵分析显示：PAB 作用16 h，MCF-7 细胞有丝分裂指数可达40% 左右，伴有cyclin B1 含量增加；PAB 促进微管解聚，干扰有丝分裂二极纺锤体形成；PAB 引起线粒体增生；PAB 导致“葡萄串样”细胞核形成，提示有丝分裂滑脱．结果表明，PAB 抑制MCF-7 细胞增殖、促进MCF-7 细胞凋亡，这些作用可能与其促进微管蛋白解聚、干扰二极纺锤体形成、阻滞有丝分裂、促进线粒体增生有关．

摘要:通过3′和5′cDNA末端快速扩增(RACE)获得了猪UCP5基因全长cDNA序列，通过不同品种猪UCP5基因编码区和调控区单核苷酸多态分析，发现 -1 567 bp处存在A→T的突变，从而导致转录因子CdxA、HNF-1、Sox-5、GATA-2结合位点发生了改变．在金华×皮特兰F2代资源群中，使用PCR限制性片段长度多态性(RFLP)方法，对524头个体进行基因型测定，并与屠体性状关联分析，结果发现，AA型活体重极显著高于BB型(P < 0.01)，AB型活体重显著高于BB型(0.01 < P < 0.05)，AA型的后腿肌肉重极显著高于BB型(P < 0.01)，AA型的后腿脂肪重显著高于BB型(0.01 < P < 0.05)．同时，通过实时荧光定量PCR获得了UCP5基因在初生仔猪心、肝、脾、肺、肾、眼肌、腹脂和大脑等不同组织中基因表达的特性，结果表明，UCP5在猪的各种组织均有表达，在脑和肺中表达量最多．t检验发现，初生达兰猪眼肌中UCP5的表达量显著高于金华猪．

摘要:蛋白质折叠速率预测是当今生物物理学最具挑战性的课题之一．近年来，许多科研工作者开展了大量的研究工作来探索折叠速率的决定因素，许多参数和方法被相继提出．但氨基酸残基间的相互作用、氨基酸的序列顺序等信息对折叠速率的影响从未被提及．采用伪氨基酸组成的方法提取氨基酸的序列顺序信息，利用蒙特卡洛方法选择最佳特征因子，建立线性回归模型进行折叠速率预测．该方法能在不需要任何(显示)结构信息的情况下，直接从蛋白质的氨基酸序列出发对折叠速率进行预测．在Jackknife交互检验方法的验证下，对含有99个蛋白质的数据集，发现折叠速率的预测值与实验值有很好的相关性，相关系数能达到0.81，预测误差仅为2.54．这一精度明显优于其他基于序列的方法，充分说明蛋白质的序列顺序信息是影响蛋白质折叠速率的重要因素．

摘要:初次卵裂时间与哺乳动物胚胎发育潜能有关．比较了不同初次卵裂时间(20～24 h，早期；25～36 h，中期；37～48 h，晚期；20～48 h，对照)的猪孤雌(parthenogenetic，PA)、体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer，SCNT)胚胎的囊胚发育率、扩张囊胚发育率和囊胚细胞数，评价其体外发育能力．发现早期卵裂的PA胚胎发育到第6天的囊胚发育率显著高于中期、晚期以及对照组(P < 0.05；54.0% vs. 19.6%，5.4%，18.7%)．扩张囊胚发育率，早裂胚胎同样优于其他组．早期卵裂的SCNT胚胎发育到第6天的囊胚比率高于中期卵裂胚胎(32.2% vs. 23.5%)，而晚期卵裂胚胎发育到囊胚的比率最低(6.3%)．早期卵裂的SCNT胚胎发育到第6天的扩张囊胚比率显著高于其余各组 (P < 0.05；18.9% vs. 5.9%、3.1%、7.4%)．囊胚细胞数在早期、中期、晚期三组之间表现出下降趋势．将早期卵裂的SCNT胚胎与未经挑选的对照组胚胎分别进行移植，观察其体内发育能力．移植早裂SCNT胚胎的受体在产仔数和克隆效率上均明显高于未经挑选胚胎的受体(4.7 vs. 2.1；3.9% vs. 0.9%)，说明早裂胚胎着床后具有更强的发育能力．以上结果表明：初次卵裂时间可以作为猪克隆胚胎发育潜能的重要标识，选择早裂的胚胎进行移植，有助于提高克隆效率．