• 2013年第40卷第12期文章目次
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    • >综述与专论
    • 自噬对血管功能的影响及与相关疾病的关联研究进展

      2013, 40(12):1177-1185.

      摘要 (4567) HTML (44) PDF 325.98 K (7319) 评论 (0) 收藏

      摘要:自噬(autophagy)是细胞利用溶酶体降解自身受损的细胞器和大分子物质的过程,在稳定细胞内环境中发挥着重要作用.研究发现,自噬影响血管功能,与血管疾病的病理生理进程密切相关.本文从自噬对血管功能的影响,与血管相关疾病(如动脉粥样硬化、腹主动脉瘤、肺动脉高压、糖尿病血管并发症等)的关系及药物对血管壁细胞自噬的调控进行综述,希望从自噬的角度来了解血管的功能和病变及一些疾病的发生发展进程,为治疗血管相关疾病提供新的思路.

    • 天然型调节性T细胞发育分化的研究进展

      2013, 40(12):1186-1192.

      摘要 (3804) HTML (39) PDF 272.82 K (7098) 评论 (0) 收藏

      摘要:CD4 CD25 调节性T细胞(Treg)对维持自身免疫耐受及调控免疫应答水平发挥非常重要的作用.Treg的缺失或紊乱导致如多发性硬化症、1型糖尿病等自身免疫性疾病的发生.研究发现,Treg在肿瘤免疫、感染免疫和移植免疫耐受中也发挥关键作用.根据来源不同,可将Treg分为胸腺来源的天然型Treg(natural Treg)和外周诱导型Treg(induced Treg)两群.天然型Treg(nTreg)是由胸腺发育分化成熟的,nTreg存在于胸腺CD4单阳性细胞中,表达CD4、CD25及叉头转录因子Foxp3,主要通过细胞与细胞之间直接接触发挥免疫抑制功能.研究表明,nTreg在胸腺中发育分化受到十分复杂的细胞、分子网络调控.胸腺微环境、T细胞受体、共刺激分子、IL-2等信号都可影响nTreg的发育分化.本文将主要对胸腺nTreg的发育分化过程及分子调控等方面进行综述.

    • 单细胞转录组研究进展

      2013, 40(12):1193-1200.

      摘要 (4436) HTML (117) PDF 348.83 K (11044) 评论 (0) 收藏

      摘要:单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战和未来发展前景进行了讨论,为该技术的进一步研究与应用提供参考.

    • 同位素稀释法在绝对定量蛋白质组中的研究进展

      2013, 40(12):1201-1208.

      摘要 (4663) HTML (118) PDF 354.08 K (7124) 评论 (0) 收藏

      摘要:绝对定量蛋白质组是指基于蛋白质组学方法对细胞、组织或体液中的蛋白质进行绝对量或浓度测定.目前,常用的绝对定量方法主要有基于同位素稀释法的蛋白质组学绝对定量方法和基于质谱数据统计分析的非标记方法.基于同位素稀释法的绝对定量方法是用已知量的同位素标记物对与其混合的样本蛋白质浓度进行测定.常见的同位素标记物包括:由AQUA法、QconCAT法产生的特异性水解肽段,由PSAQ法、Absolute SILAC法产生的标记蛋白和由PrESTs-SILAC法产生的蛋白抗原表位标签.由于同位素稀释法可以对蛋白质进行准确和精确定量,对于临床疾病的诊断和治疗具有明显的现实意义.本文对同位素稀释法在绝对定量蛋白质组中的研究进展及其优缺点和最新应用进行了评述.

    • >研究报告
    • 两种主流载体蛋白在大肠杆菌表面展示抗体应用中的系统分析

      2013, 40(12):1209-1219.

      摘要 (5102) HTML (117) PDF 881.36 K (5050) 评论 (0) 收藏

      摘要:抗体表面展示技术对于新抗体的筛选和抗体亲和力的成熟是非常重要的工具.目前,较为广泛应用的表面展示技术是噬菌体的表面展示和酵母的表面展示.大肠杆菌,以其培养简单和基因改造便捷,有望成为非常好的一种表面展示的宿主.但是,目前为止,大肠杆菌还没有被广泛地应用于抗体的表面展示技术中.主要的原因之一是在大肠杆菌外膜展示抗体的效率还不够高.作为外膜展示的载体,许多蛋白都被研究过,其中自转运蛋白(autotransporter,AT)和冰核蛋白(ice nucleation protein,INP)是人们研究最多的两种载体蛋白.还有一个原因是大肠杆菌作为宿主,在表达异源基因和展示异源蛋白过程中的存活率问题.在本研究中,系统地研究了Ag43β(一种自转运蛋白Antigen43的β结构域)和INPNC(去掉中间冗余序列的冰核蛋白的N端和C端)两种载体蛋白在强弱不同的三种启动子(T7、araBAD和lac)诱导表达的情况下,表达量、展示率、抗原亲和力以及宿主菌存活率的差异.我们发现,Ag43β展示的抗体在抗原亲和力上优于INPNC展示的抗体.在存活率方面,T7启动子诱导表达的存活率很低:用INPNC作为载体蛋白时只有0.0033%,用Ag43β作为载体蛋白时只有0.02%存活率.lac启动子诱导表达的存活率:用INPNC作为载体蛋白时为2.04%,用Ag43β作为载体蛋白时为13.27%.araBAD启动子诱导表达的存活率很高:用INPNC作为载体蛋白时为37.80%,用Ag43β作为载体蛋白时高达90.23%.但是araBAD诱导表达量和展示率都很低,所以其表现出的宿主高存活率意义有限.综合看来,由lac启动子驱动的、以Ag43?茁为载体蛋白的抗体表面展示系统是最好的选择.

    • 骨形态发生蛋白9通过JNKs激酶途径调控间充质干细胞成骨分化

      2013, 40(12):1220-1229.

      摘要 (3754) HTML (143) PDF 1.25 M (4602) 评论 (0) 收藏

      摘要:前期研究发现骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein 9,BMP9)除了通过经典Smad途径外,也可通过丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinases,MAPKs)中的p38激酶途径调控间充质干细胞成骨分化.本研究继续探讨MAPKs的重要成员c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinases,JNKs)对于BMP9诱导间充质干细胞成骨分化的调控作用.利用BMP9重组腺病毒感染间充质干细胞,通过体外细胞实验和体内动物实验,初步分析BMP9是否可通过JNKs激酶途径调控间充质干细胞成骨分化.结果表明:BMP9可通过促进JNKs激酶磷酸化而导致其活化;JNKs抑制剂SP600125可抑制由BMP9诱导的间充质干细胞的碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性、骨桥蛋白(osteocpontin,OPN)和骨钙素(osteocalcin,OCN)表达以及钙盐沉积;利用抑制剂SP600125抑制JNKs激酶活性后,BMP9诱导Runx2的表达和转录活性,以及Smad经典途径的激活也相应受到抑制;RNA干扰导致JNKs基因沉默同样也可抑制BMP9诱导的间充质干细胞成骨分化以及裸鼠皮下异位成骨.因此,BMP9可通过活化JNKs激酶途径,从而调控间充质干细胞成骨分化.

    • RNF149通过泛素化介导的CD9降解调控细胞增殖

      2013, 40(12):1230-1238.

      摘要 (3504) HTML (54) PDF 1.06 M (4971) 评论 (0) 收藏

      摘要:选取功能未知的泛素连接酶RNF149作为研究对象.该分子同GRAIL(gene related to anergy in lymphocytes)具有较高的同源性,属于Ⅰ型跨膜蛋白.激光共聚焦显微镜的观察结果显示,RNF149是一个定位在溶酶体上的蛋白质,它与CD9在细胞内有共定位.免疫共沉淀实验证明RNF149与CD9有相互作用.RNF149通过泛素分子的第48位赖氨酸多泛素化CD9.在HeLa细胞中转染数量一定的CD9质粒和数量梯度增加的RNF149质粒24 h后,蛋白质印迹检测外源RNF149和CD9的表达,结果表明,随外源RNF149表达量梯度增高,外源CD9的表达量梯度降低.在HEK293T细胞内以shRNA敲低内源的RNF149,并检测内源CD9的变化,发现RNF149被敲低后内源CD9的量增多.上述结果提示,CD9很有可能是RNF149的底物,被RNF149通过泛素化降解.此外,RNF149被敲低的HEK293T细胞增殖受到抑制,这可能与其内源CD9的量增多有关,提示RNF149可能是一种细胞增殖的调控因子.

    • 环糊精葡萄糖基转移酶钙离子结合位点结构与功能分析

      2013, 40(12):1239-1246.

      摘要 (3651) HTML (22) PDF 507.37 K (4927) 评论 (0) 收藏

      摘要:通过多重序列比对和晶体结构分析发现,钙离子结合位点CaⅠ和CaⅡ普遍存在于环糊精葡萄糖基转移酶(CGT酶)中,且两个位点处氨基酸残基具有较高的保守性,而钙离子结合位点CaⅢ仅存在于少数CGT酶中.此外,研究发现,钙离子结合位点可能与CGT酶的环化活力、热稳定性和产物特异性密切相关.

    • 轻度认知损伤患者的联系记忆损伤特征

      2013, 40(12):1247-1255.

      摘要 (3183) HTML (35) PDF 246.58 K (4356) 评论 (0) 收藏

      摘要:遗忘型轻度认知损伤患者(aMCI)在项目记忆和联系记忆上都有损伤.本文通过临床记忆量表中的项目记忆和联系记忆测验,研究aMCI的联系记忆是否比项目记忆有更显著的损伤.另外,通过分析配对联想学习测验,进一步研究aMCI联系记忆损伤的特点.25名aMCI和28名健康老人参与了两个联系记忆测验(配对联想学习测验和联想回忆测验)和两个项目记忆测验(图像自由回忆和无意义图形再认),aMCI患者在联系记忆测验上表现出了更显著的损伤,即使控制了项目记忆的损伤,aMCI的联系记忆仍然比健康老人显著降低.另外,ROC分析表明联系记忆测验比项目记忆测验对aMCI病人有更高的区分度.对配对联想学习测验的分析表明,相对于健康老人,aMCI患者在记忆有语言联系的词对要比记忆无语义联系的词对更为困难.本研究进一步表明aMCI患者的联系记忆比项目记忆有更大的损伤.相对于健康老人,aMCI患者不仅难以在两个无关项目间创建记忆连接,而且在有效利用项目间本身的语义联系方面存在更大的损伤.联系记忆测验比项目记忆测验对aMCI患者有更高的区分度.在神经心理评估中增加联系记忆测验,能更加有效地识别aMCI患者.

    • >技术与方法
    • 基于基因表达变异性的通路富集方法研究

      2013, 40(12):1256-1264.

      摘要 (3630) HTML (0) PDF 1.28 M (9401) 评论 (0) 收藏

      摘要:当前的通路富集方法主要是基于基因的表达差异,很少有方法从通路变异性(方差)角度对其富集分析.我们注意到用合适的统计量描述通路的变异性时,在疾病表型下一些通路的变异性有明显的上升或者下降.因此本研究假设:通路变异性程度在不同表型中存在差异.本文设计了14种描述通路变异性的统计量与检验方法,检测不同表型下变异性有差异的通路即富集通路,并将富集结果与文献检索结果进行比较,同时,分析不同芯片预处理方法对数据和结果的影响.研究结果表明:5种预处理方法中,多阵列对数健壮算法(RMA)是数据预处理的最优方法;不同表型下通路的变异性程度存在差异;根据文献检索的通路结果,14种基于变异性的通路富集方法中,以通路中各基因欧氏距离的方差做统计量进行permutation检验(方法11)能有效识别显著通路,其富集结果优于基因集富集分析(GSEA).综上所述,基于通路变异性的通路富集策略具有可行性,不仅对通路富集分析有一定的理论指导意义,而且为人类疾病研究提供新的视角.

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