摘要:2019年诺贝尔生理学或医学奖授予威廉·凯林（William Kaelin Jr）、彼得·拉特克里夫爵士（Sir Peter Ratcliffe）和格雷格·赛门扎（Gregg Semenza），以表彰他们在细胞感知和适应缺氧机制上做出的重要贡献. 低氧诱导因子-1（hypoxia-inducible factor-1,HIF-1）在细胞适应氧供应改变中起关键作用，可作为转录因子改变基因表达，通过提高机体携氧能力、增加血液供应、改变代谢方式等途径来适应缺氧环境. 而HIF-1的功能也受到各种机制调控：泛素化-蛋白酶体途径降解和转录因子活性抑制. HIF-1与抑癌蛋白（protein von Hippel-Lindau,pVHL）、脯氨酸羟化酶（proline hydroxylase,PHD）、HIF抑制因子（factor inhibiting HIF,FIH）等构成了严密有序的调节网络. 本文总结了3位诺贝尔奖获得者的研究成果，并结合最新的研究进展，系统阐述了HIF-1表达量调节机制和HIF-1介导的细胞适应缺氧环境机制.

摘要:

摘要:胶质母细胞瘤是成人中最恶性的颅内肿瘤，但其治疗方式在过去数十年未有突破. 随着近年精准医学和下一代测序技术的发展，使研究胶质母细胞瘤背后多维基因组学的复杂机制成为可能. 其中继发胶质母细胞瘤及与其配对的原发肿瘤是十分珍贵的数据，可用以分析低级别胶质瘤在时间和空间轴上的演化以及治疗对肿瘤的影响. 本综述阐述胶质母细胞瘤的复杂性，包括各种驱动突变、空间上的异形性和不同的演化方式；此外，会讨论如何将这些基因学上的发现应用在肿瘤预后的预测以及精准治疗上.

摘要:tRNA-derived small RNAs(tsRNA)是近年来发现的、存在于多种生物体内的一类非编码小RNA，来源于成熟tRNA或tRNA前体，其表达和修饰具有组织和细胞特异性. tsRNA参与应激反应、蛋白质翻译调控、核糖体生物合成、肿瘤发生、细胞增殖与凋亡、表观遗传信息的跨代传递等多种生理和病理过程. 本文主要对tsRNA的生成及分类、已知的生物学功能及作用机理、tsRNA 及其修饰在疾病中的作用等进行了综述.

摘要:外泌体是一种微型纳米级细胞外囊泡，由于能够直接参与细胞间信息的传递和物质的运输，被认为是细胞间通讯、免疫调节、疾病诊断和预后循环生物学标志物的重要载体，其携带的核酸和蛋白质等内含物能够影响受体细胞的生理状态. 作为一种内源性非编码微小RNA，microRNA(miRNA)对疾病诊断和治疗有着重要的研究价值，有大量证据表明该类分子对肺部疾病的发病进程起着控制调节作用. 本文聚焦于近年来细胞外泌体来源miRNA的生物学特性和功能领域，综述了近年来生物医学研究中的热点分子外泌体miRNA在肺部疾病尤其是肺纤维化中调控功能和机制的研究，因此不仅能为肺纤维化疾病的诊断提供新的标志物分子，并且还能够为肺纤维化的外泌体干预治疗建议新的干预策略.

摘要:癌症的早期诊断可提高患者生存率. 微创采集人体体液的液体活检方法可避免传统肿瘤组织活检方法侵入性和异质性的问题，逐渐成为癌症诊断的新方式. 另外，DNA甲基化作为预测癌症发生发展的标志物，引起了越来越多研究者的关注. 但传统DNA甲基化的检测方法灵敏度不高，且容易出现假阳性. 近年来，数字PCR技术因其超高的检测灵敏度和精确度、无需标准曲线即可进行核酸绝对定量检测的优势，被用于DNA甲基化的定量检测中. 本文首先介绍了DNA甲基化与癌症发生发展的关系，总结了传统DNA甲基化检测方法及其在癌症临床诊断中的应用，阐述了基于不同核酸样本分散方法的数字PCR技术及其在微量DNA甲基化检测中的优势，总结了采用数字PCR技术检测癌症患者体液中DNA甲基化的具体步骤，列举了数字PCR技术在癌症DNA甲基化检测中的研究成果及应用进展，最后提出了数字PCR技术检测癌症DNA甲基化未来可能面临的挑战，并对数字PCR技术在癌症液体活检方面的应用前景进行了展望.

摘要:在细菌DNA复制中，DnaG引物酶合成RNA引物，然后合成的引物通过DNA聚合酶进行延伸. DnaG引物酶由3个结构域组成，N端锌结合结构域（zinc-binding domain,ZBD）、RNA聚合酶结构域（RNA polymerase domain,RPD）和C端解旋酶结合结构域（helicase binding domain,HBD）. 在合成引物的过程中，引物酶的3个结构域协同作用，缺一不可. 尽管引物酶3个结构域的结构均已有研究报道，但到目前为止，引物酶的全长结构尚不清楚. 我们在上海光源利用小角X射线散射技术研究了枯草芽孢杆菌全长引物酶的溶液结构,首次构建了全长引物酶结构模型. 我们发现，枯草芽孢杆菌引物酶在溶液中处于伸展状态，且ZBD和HBD结构域相对于RPD结构域呈现出连续的构象变化. 本文研究表明DnaG引物酶中的结构域重排可能有助于其在DNA复制中发挥功能.

摘要:本文提出了一种基于空间频率滤波的多曝光融合的高动态投影层析三维成像方法，实现了活体斑马鱼（17 mm × 4 mm，最大厚度为2.33 mm,最小厚度为0.29 mm）的三维结构成像. 通过相机采用不同曝光时间记录系列吸收图像，将每张图像取变换到频域去除低频后，将各张滤波后叠加并逆傅里叶变换回空域，对变换后的图像进行归一化处理，最终获得高动态图像. 在每个投影角度获得这种高动态吸收投影图像，进行滤波反投影算法重建，获得高动态的整条斑马鱼三维结构信息. 实验成像结果表明，这种空间频率滤波多曝光融合的高动态光学投影层析三维成像研究，可以获得复杂结构更丰富的空间信息，对斑马鱼等模式生物早期胚胎生长发育进程进行监测和定量评估有一定的应用前景.

摘要:可变剪接是转录后重要的基因表达调控方式，也是转录组和蛋白质组多样性的重要来源. 近年来随着拟南芥、水稻、玉米等植物转录组测序的完成，研究人员发现植物pre-mRNA可变剪接的发生与组织分化、发育等生物学过程密切相关. 本工作基于GEO数据库的RNA-seq数据，使用高通量测序数据分析常用的Trimmomatic、Salmon、DESeq2、SUPPA2等工具，识别了拟南芥的种子、根、叶、花、花梗、节间、长角果共7种组织的表达基因和可变剪接事件，以及7种组织间的差异表达基因和差异可变剪接事件，并以叶和花为例展示了相应的生物学功能分析. 该工作系统地研究了拟南芥基因表达和可变剪接发生的组织特异性，有助于进一步阐明植物基因组的基因表达调控机制.